Theo các đại biểu Quốc hội, sau 8 năm thực hiện, bên cạnh một số kết quả đạt được, Luật Hợp tác xã năm 2003 chưa thể hiện rõ bản chất và sự khác biệt về bản chất giữa tổ chức hợp tác xã với doanh nghiệp, các tổ chức xã hội-từ thiện; chức năng quản lý nhà nước của các Bộ, ngành trong việc giám sát, kiểm tra, thi hành Luật và chính sách đặc thù khuyến khích phát triển hợp tác xã cũng chưa được quy định cụ thể trong Luật…

Về quy định hợp tác xã góp vốn, mua cổ phần, thành lập công ty, đa số các ý kiến nhất trí với dự thảo Luật cho phép hợp tác xã góp vốn, mua cổ phần, thành lập công ty trực thuộc. Tuy nhiên, cần làm rõ căn cứ pháp lý quy định mức vốn góp của thành viên hợp tác xã không vượt quá 20% vốn điều lệ hợp tác xã được quy định tại Điều 18 của Dự thảo Luật.

Đại biểu Đinh Thị Phương Thanh, đoàn Long An cho rằng: Theo giải trình của Ban soạn thảo về vấn đề này tại báo cáo tiếp thu giải trình ý kiến đóng góp của đại biểu Quốc hội (báo cáo số 4403 ngày 15/6/2012) là chưa đủ sức thuyết phục, vì xã viên góp nhiều vốn hay ít vốn một khi chấp nhận điều lệ hợp tác xã thì họ đều có phiếu biểu quyết như nhau trong việc quyết định các vấn đề thuộc thẩm quyền của Đại hội xã viên như: Phương án, kế hoạch hoạt động sản xuất kinh doanh, phân phối thu nhập của hợp tác xã...